Qu'est-ce qu'un pôle d'animation ?
Un pôle est un groupe de travail qui rassemble les personnes intéressées pour travailler ensemble sur une problématique d'intérêt commune. L'objectif est d'échanger sur des outils, des méthodes et des pratiques, organiser une veille ou une production scientifique (développement d'outil, benchmark, review).
Les pôles actifs
Le principe est de rassembler un groupe de travail/discussion autour de l'annotation structurale et fonctionnelle des génomes, avoir des retour d'expériences sur des outils d'annotation, sans attendre un benchmark mais plus une vision d'utilisateur, avantage, inconvénient pour répondre à une question.
Le pôle d’animation “Partage autour de l'Intelligence Artificielle en Génomique” a pour objectif de créer un espace d'échange dédié à l'application de l'intelligence artificielle dans le domaine de la génomique. Ce pôle d'animation encourage le partage de connaissances, de méthodologies, d’outils et de résultats autour de l’application de solutions innovantes de l'IA dans le domaine de la génomique, afin de relever les défis actuels liés à l’analyse et à l’interprétation de ces grands jeux de données.
Le principe est de partager sur les techniques et approches bioinformatiques utilisées pour identifier les espèces présentes dans un écosystème donné à partir de données de séquençage amplicon (ARN16s, ARN18s, ITS) ou métagénomique shotgun. Nous échangeons sur les méthodes et outils existants, et les analyses de chacun.
Ce pôle met en relation les bioinformaticiens maintenant des systèmes d'information qui intégrent des jeux de données omiques, la description des échantillons concernés et les métadonnées qui y sont associées. Il a pour objectif de discuter ou de proposer des modèles de données pratiques, standards, efficaces pour collecter, décrire et comparer ces données. C'est aussi l'occasion d'échanger sur les technologies de bases de données (relationnel, noSQL, RDF, graphes, etc...) et des outils pour les alimenter, les interroger et les interfacer.
Vous ne vous sentez concernés par aucun des pôles présentés ?
Lancez un appel pour trouver des collaborateurs autour d’une thématique sur la liste de diffusion bioinformaticiens@inra.fr !